Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp2Q06649 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp2Q06649 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms