Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prrx2Q06348 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prrx2Q06348 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms