Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Thbs3Q05895 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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