Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk18Q04899 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms