Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scg2Q03517 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Scg2Q03517 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms