Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx2Q03358 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms