Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thbs2Q03350 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms