Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgfr4Q03142 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgfr4Q03142 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms