Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp11Q02853 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms