Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gjb4Q02738 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms