Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pax5Q02650 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms