Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1cQ01815 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1cQ01815 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms