Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mc1rQ01727 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mc1rQ01727 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms