Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HmgcrQ01237 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms