Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pde1bQ01065 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pde1bQ01065 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms