Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbp4Q00724 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms