Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms