Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AlkP97793 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AlkP97793 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AlkP97793 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AlkP97793 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AlkP97793 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AlkP97793 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AlkP97793 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AlkP97793 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AlkP97793 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AlkP97793 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlkP97793 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlkP97793 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AlkP97793 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AlkP97793 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AlkP97793 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms