Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gata5P97489 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms