Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx2P97474 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms