Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lig3P97386 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms