Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gbx1P82976 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbx1P82976 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms