Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf1P81269 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atf1P81269 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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