Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms