Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx3P81067 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx3P81067 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx3P81067 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx3P81067 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx3P81067 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx3P81067 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx3P81067 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms