Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cct7P80313 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cct7P80313 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct7P80313 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct7P80313 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct7P80313 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct7P80313 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cct7P80313 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms