Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1bP70700 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr1bP70700 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms