Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ldb1P70662 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ldb1P70662 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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