Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcr4P70658 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cxcr4P70658 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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