Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad50P70388 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms