Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ufd1P70362 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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