Protein–RNA interactions for Protein: P70353

Nfyc, Nuclear transcription factor Y subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfycP70353 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfycP70353 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfycP70353 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfycP70353 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfycP70353 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfycP70353 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms