Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad54lP70270 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms