Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Barhl1P63157 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Barhl1P63157 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms