Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UbdP63072 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UbdP63072 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UbdP63072 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UbdP63072 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UbdP63072 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UbdP63072 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms