Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tra2bP62996 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tra2bP62996 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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