Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rps27aP62983 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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