Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps3P62908 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps3P62908 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps3P62908 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms