Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps28P62858 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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