Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab1AP62821 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab1AP62821 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms