Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snrpd3P62320 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms