Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd2P62317 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd2P62317 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms