Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms