Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arf3P61205 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arf3P61205 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms