Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2d1P61080 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms