Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ActbP60710 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ActbP60710 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ActbP60710 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ActbP60710 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ActbP60710 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ActbP60710 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ActbP60710 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms