Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3eP60229 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Eif3eP60229 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms