Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps5P59438 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps5P59438 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms