Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphp4P59240 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms