Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdrg1P59048 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Pdrg1P59048 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdrg1P59048 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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